Aparentemente Sydney Bristow es sólo una atractiva e inteligente estudiante, pero en realidad lleva una doble vida: acaba de ser reclutada por SD-6, una división secreta de la CIA. Su vida y la de todos los que la rodean cambiará radicalmente a partir de ese momento.
El SD-6 ha preparado a Sydney casi para cualquier cosa, pero de pronto tiene que enfrentarse con algo que nunca imaginó: una serie de asombrosos descubrimientos hacen a Sydney darse cuenta de que su vida corre peligro y la única persona que puede ayudarle es alguien que apenas conoce... su padre.