Latios y a Latias son dos nuevos personajes Pokémon con poderes extraordinarios. En una mágica ciudad acuática llena de laberintos y canales, ASH, PIKACHU, y el resto de su pandilla tendrán que enfrentarse a un par de astutos ladrones que planean robar una valiosísima y peligrosa joya custodiada por Latios y Latias.