En el año 2015 la humanidad se enfrenta a la mayor amenaza que haya conocido jamás: unos misteriosos seres denominados Ángeles que siembran el pánico y la destrucción por donde aparecen. Nadie conoce su origen ni sus motivaciones, pero la alerta se ha disparado a nivel mundial.
Con el objetivo de frenar esta mortal amenaza, las Naciones Unidas han encargado a la organización secreta Nerv la creación de unos gigantescos androides conocidos como Evangelions. Cinco pilotos han sido elegidos para pilotar el arma definitiva, lo único que separa a los seres humanos de la supervivencia o el total aniquilamiento.
Es la batalla final entre la raza humana y los ángeles.